MISS’D kafe mengisahkan lima sahabat iaitu Malaika, Irdina, Shakinah, Syarah dan Dahlia yang sangat rapat sejak berada di bangku sekolah menengah semasa di tingkatan dua. Mereka memasang impian yang tinggi iaitu ingin mendirikan sebuah kafe impian pada masa yang akan datang. Kini setelah mereka menghabiskan pengajian mereka di universiti, mereka sama-sama merealisasikan impian besar mereka. Tanpa diduga, diseberang jalan di hadapan kafe mereka, terdapat satu lagi kedai. Mereka beranggapan bahawa kedai itu akan menjadi persaingan kafe mereka. Namun seorang demi seorang bermula daripada Syarah sudah pun mula memerhatikan kedai tersebut kerana khuatir akan sesuatu yang mungkin akan terjadi. Pada hari perasmian mereka membuka kafe MISS’D, kedai yang bertentangan di depan mereka juga melakukan yang sama. Mereka juga membuka sebuah kafe yang dipanggil, MR. J.

Pada mulanya mereka tidak mengesyaki yang bukan-bukan kerana mereka berfikir itu hanyalah perasaan mereka tetapi semuanya berakhir apabila kafe mereka baru sahaja mula menjadi terkenal dan dikenali oleh ramai orang, mereka disabotaj! Kelima-lima sahabat disabotaj tanpa mereka sedari siapakah yang dalang disebaliknya. Adakah mereka disabotaj oleh pekerja-pekerja kafe MR. J?

Adakah musuh saingan mereka mempunyai kaitan dengan masa silam mereka? Adakah mereka telah melakukan perbuatan yang jahat terhadap mereka pada suatu masa ketika dahulu? Ini kerana kelima-lima sahabat merasakan bahawa mereka pernah berjumpa dengan pekerja-pekerja tersebut pada masa silam mereka.